Alinhamento Multiplo De Sequencias
Mostrando 1-12 de 18 artigos, teses e dissertações.
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1. Modelagem molecular proteica dos marcadores genéticos do câncer de tireoide
RESUMO Introdução: Os avanços nos estudos de biologia molecular da tireoide não fornecem apenas uma visão sobre as doenças tireoidianas, mas um diagnóstico preciso do câncer de tireoide. Objetivo: Realizar um tutorial sobre modelagem molecular proteica dos marcadores genéticos do câncer de tireoide. Métodos: As proteínas foram selecionadas uti
J. Bras. Patol. Med. Lab.. Publicado em: 2016-10
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2. Identificação molecular de espécies de Trichogramma de regiões do Brasil utilizando o sequenciamento da região ITS2 do DNA ribossomal
O objetivo deste trabalho foi realizar a identificação e diferenciação das espécies Trichogramma exiguum Pinto e Platner, T. pretiosum Riley e T. galloi Zucchi utilizando o sequenciamento da região ITS2 do DNA ribossomal. Após a extração do DNA das espécies estudadas, foi realizada a reação de PCR, onde as amostras amplificadas foram submetidas a
Braz. J. Biol.. Publicado em: 2015-05
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3. Mutações pontuais em sequências expressas da enzima lipoxigenase em tegumentos de sementes de soja de coloração preta
Enzimas lipoxigenases possuem relevância em diversas características das sementes de soja, como desempenho germinativo, capacidade de armazenamento e tolerância ao ataque de microrganismos. Nesse sentido, o estudo de variações alélicas de genes relacionados a essa enzima podem ser promissores para o desenvolvimento de marcadores moleculares relacionado
J. Seed Sci.. Publicado em: 2013
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4. Self-organization of population in Artificial Immune Systems applied to the protein docking / Auto-organização da população em sistemas imunológicos artificiais aplicada ao docking de proteínas
Vários problemas do mundo real podem ser analisados como problemas de otimização. Na bioinformática, em especial, como exemplos podem ser citados o alinhamento múltiplo de sequências, a filogenia, a predição de estruturas de proteínas e RNA, entre outros. As Meta-heurísticas Populacionais (MhP) são técnicas baseadas em interações de conjuntos d
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 17/07/2012
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5. Sequências, propriedades e função de β-1,3-glucanases de insetos / Sequences, properties and function of insect β-1,3-glucanases
β-1,3-glucanases são enzimas encontradas em muitos organismos, como fungos, bactéria e plantas. Suas funções incluem remodelamento de parede celular, defesa e digestão. É um alvo interessante para o controle populacional de insetos-praga, porque é ausente em vertebrados. Em insetos, é encontrada no intestino de muitas ordens diferentes, e hidrol
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 03/10/2011
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6. Análise preliminar de um processo para identificação e alinhamento de seqüências homólogas para proteínas com estrutura resolvida.
O objetivo deste trabalho é apresentar e fazer uma avaliação preliminar de um processo alternativo, denominado Sequences Homologue to the Query (Structure-having) Sequence-SH2Q, para elaboração de alinhamentos múltiplos semelhantes à aqueles relatados no HSSP. O processo aqui apresentado baseia-se em programas de domínio público para busca em bases
Campinas: Embrapa Informática Agropecuária. Publicado em: 2011
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7. Identificação de genes e o Problema do Alinhamento Spliced Múltiplo
The gene prediction in DNA sequences of eukariotic organisms is still an open problem in Bioinformatics. The sequence comparison based approach is commonly used in the search of solutions for this problem. Several different combinations of sequences are being used by gene recognition tools and in this work we propose the comparison of many cDNA sequences wit
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 14/12/2010
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8. Caracterização molecular de acessos de Cratylia argentea e sua relação filogenética com outras leguminosas
O objetivo deste trabalho foi realizar a caracterização molecular de 11 acessos de Cratylia argentea, com base no sequenciamento da região ITS (ITS1/5,8S/ITS2), bem como o estabelecimento de suas relações filogenéticas com outras leguminosas. As relações filogenéticas dessa espécie com outras 15 leguminosas foram estabelecidas com o uso de sequênc
Pesquisa Agropecuária Brasileira. Publicado em: 2010-08
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9. Alinhamento múltiplo progressivo de sequências de proteínas / Progressive multiple alignment of protein sequences
O alinhamento múltiplo dc sequências é uma tarefa de grande relevância cm Bioin-formática. Através dele é possível estudar eventos evolucionários c restrições estruturais ou funcionais, sejam de sequências de proteína, DNA ou RNA, tornando possível entender a estrutura, função c evolução dos genes que compõem um organismo. O objetivo do al
Publicado em: 2010
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10. Estratégia distribuída híbrida em cluster multicore heterogêneo para alinhamento múltiplo de sequencias biológicas com o dialign-tx
O Alinhamento Múltiplo de Sequências (AMS) é um problema importante em Bioinformática, permitindo a interpretação de árvores filogenéticas, a identificação de domínios e padrões conservados e a predição de estruturas secundárias. Como o AMS é um problema NP-Difícil, heurísticas são utilizadas. O programa DIALIGN-TX implementa uma heurísti
Publicado em: 2010
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11. Detecção e caracterização molecular de norovírus genotipos GII-11 e GII-19 em suínos assintomáticos
Os norovírus (NoV) são os maiores causadores de gastroenterites não-bacterianas em seres humanos no mundo todo, incluindo os casos associados com surtos de origem alimentar e veiculados pela água. Os membros da família Caliciviridae são vírus pequenos, ãoenvelopados e apresentam genoma de RNA fita simples positiva e poliadenilada. As noroviroses tamb
Publicado em: 2010
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12. Estratégia paralela para alinhamento múltiplo de sequências com algoritmo genético multi-ilha
O Alinhamento Múltiplo de Sequências genéticas (AMS) é executado milhares de vezes ao dia por cientistas, a fim de identificar regiões de semelhança entre três ou mais sequências. Os alinhamentos múltiplos assim obtidos são usados na resolução de problemas complexos, como a determinação do histórico evolutivo das espécies. Por se tratar de um
Publicado em: 2009