Base excision repair in sugarcane

AUTOR(ES)

Agnez-Lima, Lucymara F., Medeiros, Sílvia R. Batistuzzo de, Maggi, Bruno S., Quaresma, Giovanna A.S.

FONTE

Genetics and Molecular Biology

DATA DE PUBLICAÇÃO

2001-12

RESUMO

Danos no DNA podem ser induzidos por um grande número de agentes físicos e químicos presentes no ambiente, como também por compostos produzidos pelo próprio metabolismo celular. Estes danos podem interferir com processos celulares como replicação e transcrição, levando a morte celular e/ou mutações. Os baixos níveis de mutação nas células são devidos à presença de vias enzimáticas, que reparam os danos no DNA. Diversos genes de reparo de DNA têm sido clonados e seus produtos caracterizados, principalmente em bactérias, leveduras e mamíferos. O interesse no estudo de mecanismos de reparo de DNA advém de seu envolvimento com a proteção da integridade da informação genética. A alta conservação observada para a maioria dos genes relacionados ao reparo de DNA, especialmente em eucariotos, aponta para sua importância para a manutenção da vida na terra. Em plantas, o conhecimento sobre os mecanismos de reparo de DNA é ainda reduzido. Os primeiros genes de reparo foram recentemente clonados e o mecanismo de ação de seus produtos está por ser caracterizado. Nosso objetivo neste trabalho de data mining foi identificar, no banco de dados gerados pelo projeto Genoma da Cana de Açúcar (Sugarcane Expressed Tag Project-SUCEST), genes relacionados ao reparo por excisão de bases (BER). Esta busca foi feita através do programa tblastn. Em cana de açúcar, foram identificados clusters homólogos para a maioria das proteínas BER analisadas e um alto grau de conservação foi observado. Os melhores resultados foram obtidos com proteínas BER de Arabidopsis thaliana. Para alguns homólogos BER de cana de açúcar, a presença de mais de uma forma de mRNA é possível, como definido pela ocorrência de mais de um cluster homólogo.

Documentos Relacionados

• Overlapping Specificities of Base Excision Repair, Nucleotide Excision Repair, Recombination, and Translesion Synthesis Pathways for DNA Base Damage in Saccharomyces cerevisiae
• DNA repair in higher plants; photoreactivation is the major DNA repair pathway in non-proliferating cells while excision repair (nucleotide excision repair and base excision repair) is active in proliferating cells
• A role for p53 in base excision repair
• Base excision repair in the thermophile Thermus sp. strain X-1.
• DNA base excision repair of uracil residues in reconstituted nucleosome core particles