Homo sapiens : análise de expressão gênica por transcriptograma

AUTOR(ES)
DATA DE PUBLICAÇÃO

2011

RESUMO

O proteoma - o grupo de proteínas produzidas na célula - e suas interações formam uma rede complexa que determina o funcionamento e desenvolvimento celular. Devido a enorme quantidade de dados disponíveis, novas ferramentas são necessárias para organizar e identificar processos relevantes dentro do proteoma, permitindo uma análise de larga-escala (i.e. proteômica) em vez de pequena-escala (i.e. proteica). Neste trabalho, usamos um algoritmo de minimização de custo para organizar o proteoma humano e identificar módulos interativos, e mostramos que esses módulos podem ser compostos por proteínas de funções biológicas semelhantes. Finalmente, apresentamos o transcriptograma de células de tecido pulmonar humano normal e canceroso (adenocarcinoma). O transcriptograma mostra níveis de expressão gênica ao longo da rede ordenada, possibilitando a análise de larga-escala da dinâmica celular e tornando-o uma ferramenta poderosa de diagnóstico. Neste estudo, mostramos que ele pode ser usado para identificar módulos de proteínas que são expressas em níveis alterados em tecido normal e canceroso de fumantes e ex-fumantes, em comparação com tecido normal de não-fumantes.

ASSUNTO(S)

proteômica expressão gênica proteinas método de monte carlo

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