Molecular chaperone genes in the sugarcane expressed sequence database (SUCEST)
AUTOR(ES)
Borges, Júlio C., Peroto, Maria C., Ramos, Carlos H.I.
FONTE
Genetics and Molecular Biology
DATA DE PUBLICAÇÃO
2001-12
RESUMO
Algumas proteínas ao serem sintetizadas necessitam do auxílio de chaperones moleculares para seu correto enovelamento. Chaperones também estão envolvidas na dissolução de agregados protéicos, fazendo com que seu estudo seja de relevância biotecnológica e médica. Portanto, a identificação de seqüências de chaperones moleculares é uma tarefa importante. Nós usamos ferramentas de bioinformática para procurar informações geradas pelo sugarcane EST Genome Project (SUCEST) a fim de identificar e anotar chaperones e proteínas relacionas ao estresse. As seqüências do SUCEST eram anotadas como pertencentes a uma categoria de proteínas se o E-value encontrado fosse menor que 1,0e-05. Nossas anotações mostram que 4.164 seqüências 5’ EST são homólogas a chaperones moleculares, aproximadamente 1,8% de todos os 5’ EST que foram seqüenciados pelo SUCEST. Deste total, cerca de 44% pertence à família Hsp70 e suas co-chaperones, 10% à família Hsp90 e 13% à peptidil cis, trans isomerase. Do resultado da anotação, nós predizemos a existência de 156 diferentes subclasses de genes relacionados a chaperones no genoma da cana-de-açúcar. Juntos, nossos resultados apontam que os genes que codificam para estas proteínas são diversos e abundantemente expressos, o que enfatiza sua importância biológica.
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