Ordenamento por função custo de redes de interações protéicas : estudo da Arabidopsis thaliana

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DATA DE PUBLICAÇÃO

2011

RESUMO

Determinar com precisão o papel de cada agente bioquímico em todos os processos relevantes que ocorrem na célula se revelou uma tarefa complicada. Métodos locais, que se concentram apenas em um pequeno conjunto de componentes, não são capazes de explicar o funcionamento da célula em um nível que nos permita entender processos mais complexos, como o envelhecimento. Porém, a análise local sugere que o genoma pode ser considerado uma rede modular, onde genes integrantes de um mesmo módulo interagem mais fortemente entre si do que com genes integrantes de outros módulos. Este trabalho propõe a análise de um método que ordena uma lista de genes interagentes utilizando uma dinâmica de Monte Carlo, com o objetivo de agrupar unidimensionalmente os genes com interações mais fortes. A partir dessa lista ordenada, é possível perceber a separação em módulos funcionais da lista de genes e observar uma correlação entre esses módulos e a ativação dos genes durante variados processos biológicos realizados pela célula.

ASSUNTO(S)

genoma genetica vegetal método de monte carlo dinamica de rede

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