Ferramentas De Analise De Expressao Genica
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1. Pipeline para Análise In Sílico de Dados de Expressão de miRNAs e mRNAs em Células de Mamíferos. / Pipeline for in silico Analysis of miRNAs and mRNAs Expression Data in Mammals Cells.
Os microRNAs estão envolvidos no processo de regulação da expressão gênica da célula, onde a molécula de microRNA se liga com o RNA mensageiro interrompendo, assim, a expressão do respectivo gene pela interrupção da tradução. A bioinformática tem auxiliado na identificação de vários genes codificadores de microRNAs em plantas e animais, inclu
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 13/04/2012
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2. Uma abordagem baseada em ontologias e conectores para a integração semântica de ferramentas de análise de expressão gênica / An Approach Based on Ontologies and Connectors for Semantic Integration of Gene Expression Analysis Tools
As pesquisas em biologia molecular têm produzido uma grande quantidade de dados, os quais embutem informações sobre diferentes fenômenos biológicos. Neste sentido, a bioinformática se destaca como uma área de pesquisa multidisciplinar que visa, principalmente, o desenvolvimento de ferramentas (sistemas) computacionais para auxiliar na descoberta de co
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 15/12/2011
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3. Metilação do gene simportador sódio-iodo (NIS) em tumores de tireóide / Methylation of sodium iodide symporter (NIS) gene in thyroid tumors
O iodo é transportado para a célula tireoideana através do simportador sódio-iodo (NIS). Estudo anterior de nosso grupo mostrou que a expressão do RNAm de NIS estava reduzida nos tecidos tumorais (T) tireoideanos quando comparada à dos tecidos não tumorais (NT) adjacentes. A metilação de ilhas CpG localizadas em promotores é um dos mecanismos epige
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 15/12/2011
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4. Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para análises de expressão gênica em larga escala / Development of bioinformatics tools for large-scale gene expression analysis
A construção de perfis de expressão usando microarrays tornou-se um método amplamente utilizado para o estudo dos padrões de expressão gênica. Estes estudos produzem uma grande quantidade de dados que faz com que a análise seja complexa e demorada. À medida que a qualidade dos arrays se torna mais confiável com a introdução dos arrays industriais
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 22/07/2011
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5. Mutação eqlb causa alteração na expressão de genes do controle do ciclo celular de precursores de neurônios cerebelares
Várias doenças humanas atualmente conhecidas têm causas genéticas. Uma maneira de se entender as alterações moleculares que levam a essas doenças é através da análise da disfunção de um gene, que pode ser feito usando modelos animais que recapitulem tais patologias. O camundongo desempenha muito bem essa função, devido à alta porcentagem de ho
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 27/04/2011
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6. Redes complexas de expressão gênica: síntese, identificação, análise e aplicações / Gene expression complex networks: synthesis, identification, analysis and applications
Os avanços na pesquisa em biologia molecular e bioquímica permitiram o desenvolvimento de técnicas capazes de extrair informações moleculares de milhares de genes simultaneamente, como DNA Microarrays, SAGE e, mais recentemente RNA-Seq, gerando um volume massivo de dados biológicos. O mapeamento dos níveis de transcrição dos genes em larga escala é
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 21/02/2011
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7. Homo sapiens : análise de expressão gênica por transcriptograma
O proteoma - o grupo de proteínas produzidas na célula - e suas interações formam uma rede complexa que determina o funcionamento e desenvolvimento celular. Devido a enorme quantidade de dados disponíveis, novas ferramentas são necessárias para organizar e identificar processos relevantes dentro do proteoma, permitindo uma análise de larga-escala (i.
Publicado em: 2011
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8. Identificação e caracterização do perfil transcricional de genes durante o desenvolvimento inicial do fruto em videira sem sementes (Vitis vinifera L. Cv 'Sultanina')
A obtenção de novas cultivares de uvas de mesa e a compreensão da regulação da expressão gênica, associada à formação do fruto de uma cultivar de uva sem semente, constituem pré-requisitos essenciais para o desenvolvimento de ferramentas aplicadas ao melhoramento genético para essas espécies. Com este objetivo, dois trabalhos foram conduzidos a
Publicado em: 2011
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9. Estudo da diversidade tumoral e desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para análise citogenética e molecular de neoplasias sólidas
A progressão das neoplasias sólidas é um processo complexo, não segue uma seqüência universal e é caracterizada pela marcada heterogeneidade tumoral na ocasião do diagnóstico. Anormalidades cromossômicas, mutações somáticas e alterações epigenéticas estão entre as principais alterações celulares decorrentes da instabilidade do genoma desta
Publicado em: 2011
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10. ACC sintase em cana-de-áçucar : estudos de regulação gênica e aplicação biotecnológica / Sugarcane ACC synthase : studies of gene regulation and biotechnology application
A cultura da cana-de-açúcar (Saccharum spp) está entre as mais importantes do Brasil, tendo o setor sucroalcooleiro grande importância econômica no país devido ao crescente consumo de álcool e açúcar. A fase de maturação no desenvolvimento da cana-de-açúcar é especialmente interessante, pois está diretamente relacionada com o teor de sacarose.
Publicado em: 2011
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11. Análise quantitativa do RNA mensageiro associada aos diferentes esquemas imunossupressores em pacientes transplantados renais : avaliação pela reação em cadeia da polimerase em tempo real em células sanguíneas e do sedimento urinário
Introdução: Técnicas que possibilitem o diagnóstico não-invasivo das condições que afetam a sobrevida dos transplantes e os mecanismos associados ao seu desenvolvimento encontram-se em intensa investigação. Este estudo objetiva delinear perfis de expressão de RNA mensageiro de alo-imunidade, tolerância, fibrose e injúria tubular aguda associados
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 2011
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12. Análise do transcriptoma do estágio invasivo de Fasciola hepatica e sua contribuição na compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos no processo de infecção
Fasciola hepatica é um trematódeo parasita e o agente causador da fasciolose. Esta zoonose causa perdas importantes na produção agropecuária e tem uma crescente incidência na saúde dos seres humanos, principalmente em países em desenvolvimento. Mesmo que existem drogas fasciolicidas, estas não evitam a reinfecção e o surgimento de resistência e,
Publicado em: 2011